Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vil1Q62468 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vil1Q62468 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms