Protein–RNA interactions for Protein: Q62442

Vamp1, Vesicle-associated membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp1Q62442 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vamp1Q62442 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vamp1Q62442 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms