Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxa13Q62424 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxa13Q62424 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
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