Protein–RNA interactions for Protein: Q62266

Sprr1a, Cornifin-A, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1aQ62266 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Sprr1aQ62266 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sprr1aQ62266 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms