Protein–RNA interactions for Protein: Q62261

Sptbn1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn1Q62261 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Sptbn1Q62261 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sptbn1Q62261 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms