Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Sall3Q62255 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Sall3Q62255 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Sall3Q62255 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms