Protein–RNA interactions for Protein: Q62132

Ptprr, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprrQ62132 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
PtprrQ62132 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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PtprrQ62132 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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PtprrQ62132 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PtprrQ62132 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PtprrQ62132 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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PtprrQ62132 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprrQ62132 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms