Protein–RNA interactions for Protein: Q62035

Ptafr, Platelet-activating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtafrQ62035 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PtafrQ62035 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PtafrQ62035 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms