Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
AtrxQ61687 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
AtrxQ61687 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms