Protein–RNA interactions for Protein: Q61635

Ifi47, GTP-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi47Q61635 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Ifi47Q61635 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ifi47Q61635 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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Ifi47Q61635 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
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Ifi47Q61635 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ifi47Q61635 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ifi47Q61635 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms