Protein–RNA interactions for Protein: Q61476

Cd55b, Complement decay-accelerating factor transmembrane isoform, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd55bQ61476 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cd55bQ61476 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cd55bQ61476 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms