Protein–RNA interactions for Protein: Q61450

Gp49a, Mast cell surface glycoprotein Gp49A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp49aQ61450 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gp49aQ61450 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms