Protein–RNA interactions for Protein: Q61409

Pde3b, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde3bQ61409 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Pde3bQ61409 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Pde3bQ61409 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms