Protein–RNA interactions for Protein: Q61290

Cacna1e, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, mousemouse

Predictions only

Length 2,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1eQ61290 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cacna1eQ61290 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cacna1eQ61290 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms