Protein–RNA interactions for Protein: Q61191

Hcfc1, Host cell factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc1Q61191 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Hcfc1Q61191 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hcfc1Q61191 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms