Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Foxg1Q60987 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Foxg1Q60987 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms