Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cep250Q60952 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cep250Q60952 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms