Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Cdkn2cQ60772 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cdkn2cQ60772 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms