Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Gm26826-201ENSMUST00000181317 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mkrn3Q60764 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mkrn3Q60764 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms