Protein–RNA interactions for Protein: Q60688

Foxd4, Forkhead box protein D4, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd4Q60688 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Foxd4Q60688 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Foxd4Q60688 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms