Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
ItgaeQ60677 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ItgaeQ60677 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgaeQ60677 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgaeQ60677 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgaeQ60677 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgaeQ60677 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgaeQ60677 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgaeQ60677 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgaeQ60677 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgaeQ60677 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgaeQ60677 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ItgaeQ60677 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms