Protein–RNA interactions for Protein: Q60670

Sik1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sik1Q60670 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sik1Q60670 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sik1Q60670 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sik1Q60670 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms