Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4C3

Scaf1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf1Q5U4C3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Scaf1Q5U4C3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scaf1Q5U4C3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scaf1Q5U4C3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.6 ms