Protein–RNA interactions for Protein: Q5U430

Ubr3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubr3Q5U430 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ubr3Q5U430 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ubr3Q5U430 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms