Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Myh1Q5SX40 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Myh1Q5SX40 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myh1Q5SX40 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms