Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX39

Myh4, Myosin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,939 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh4Q5SX39 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Myh4Q5SX39 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Myh4Q5SX39 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms