Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Med13Q5SWW4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Med13Q5SWW4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms