Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ankrd40Q5SUE8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms