Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Bbs12Q5SUD9 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Bbs12Q5SUD9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms