Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQF8

Sap30l, Histone deacetylase complex subunit SAP30L, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap30lQ5SQF8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sap30lQ5SQF8 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sap30lQ5SQF8 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sap30lQ5SQF8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sap30lQ5SQF8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Sap30lQ5SQF8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sap30lQ5SQF8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms