Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc85aQ5SP85 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc85aQ5SP85 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms