Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCC9

Trim58, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM58, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim58Q5NCC9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim58Q5NCC9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trim58Q5NCC9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms