Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB2

Gm12185, Predicted gene 12185, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12185Q5NCB2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm12185Q5NCB2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm12185Q5NCB2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm12185Q5NCB2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm12185Q5NCB2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm12185Q5NCB2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm12185Q5NCB2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm12185Q5NCB2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms