Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC48

Gm12253, Predicted gene 12253, mousemouse

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Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12253Q5NC48 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm12253Q5NC48 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm12253Q5NC48 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gm12253Q5NC48 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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