Protein–RNA interactions for Protein: Q5GFD5

Hs3st6, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 6, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs3st6Q5GFD5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hs3st6Q5GFD5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms