Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ndufaf2Q59J78 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ndufaf2Q59J78 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms