Protein–RNA interactions for Protein: Q571E5

Prss53, Serine protease 53, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss53Q571E5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Prss53Q571E5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Prss53Q571E5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms