Protein–RNA interactions for Protein: Q569L8

Cenpj, Centromere protein J, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpjQ569L8 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CenpjQ569L8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CenpjQ569L8 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CenpjQ569L8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms