Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccnl1Q52KE7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ccnl1Q52KE7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ccnl1Q52KE7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms