Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJN1

C1qtnf9, Complement C1q and tumor necrosis factor-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf9Q4ZJN1 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
C1qtnf9Q4ZJN1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
C1qtnf9Q4ZJN1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms