Protein–RNA interactions for Protein: Q4VA36

Ccdc84, Coiled-coil domain-containing protein 84, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc84Q4VA36 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Ccdc84Q4VA36 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc84Q4VA36 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms