Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm527Q4KL13 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gm527Q4KL13 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms