Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrrc43Q3V0L5 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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Lrrc43Q3V0L5 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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Lrrc43Q3V0L5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrrc43Q3V0L5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms