Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Capn13Q3UW68 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Capn13Q3UW68 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms