Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Clpsl2Q3UW21 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Clpsl2Q3UW21 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms