Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slfn4Q3UV66 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Slfn4Q3UV66 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms