Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prom2Q3UUY6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Prom2Q3UUY6 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prom2Q3UUY6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms