Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Chpf2Q3UU43 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chpf2Q3UU43 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 868.1 ms