Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
BB287469Q3UT53 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
BB287469Q3UT53 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms