Protein–RNA interactions for Protein: Q3URS9

Ccdc51, Coiled-coil domain-containing protein 51, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc51Q3URS9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc51Q3URS9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc51Q3URS9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms